Старшие Боги наблюдали за Мирами и правили ими с несказанной мудростью, но один из Старших Богов - Лорд Шиннок - поддался жадности и иллюзиям о безграничном могуществе. Он захотел подчинить себе Земное Царство, но Старшие Боги назначили молодого бога Грома - Рейдена - защищать Землю. Битва между Рейденом и Шинноком была жестокой и едва не уничтожила Землю, ввергнув планету в века тьмы, а раса рапторов, населявших тогда Земной Мир, была практически уничтожена.

Рейден узнал, что Шиннок попал в реальность используя Магический Амулет. Амулет позволил ослабить границы реальности и войти в неё без проведения турнира. Бог грома лишил Шиннока его Амулета и при помощи Старших Богов скинул его в Преисподнюю. После этой Великой победы были созданы люди, чтобы возвести храм в Гималайских горах. Туда-то и был помещен Амулет. Лорд Рейден назначил четырех стражей, чтобы защитить артефакт, каждый из которых представлял один из четырех элементов, которые составляют Земной Мир: Воздух (Фуджин), Земля, Вода, и Огонь. Известные под многими именами, они - четыре основных бога, которые необходимы для баланса сил Земли. Пока Амулет остается на Земле, в недосягаемости Шиннока, падший бог остается в ловушке Нереальности.

За тысячелетия истории и легенды, которые передавались из поколения в поколение, в конечном счете, умерли. Эти события были описаны только в одной книге - в Священной Карте Элементов. Эта карта повествует о великом сражении между Шинноком и Рейденом и показывает путь к храму в Гималаях.

Спустя долгое время, волшебник - Куан Чи - пришел к Шинноку, узнав о его страданиях в Нереальности. Колдун согласился освободить падшего бога и помочь ему победить Люцифера в обмен на силу и позицию в армии Шиннока. Сплоченные союзники подняли войну против Люцифера и его сил, которая продолжалось в течение многих столетий. В конечном счете, она закончилась победой Шиннока, который занял место Люцифера. Он создал Братство Теней, куда входили приближенные к нему фигуры ада. Но в отличие от Внешнего Мира, Нереальность никогда не была живой планетой - Шиннок не имел ничего, кроме пустоши огня и дыма, населенной уродливыми демонами. Так он и решил создать материальный мир: он придал демонам человеческую форму, насколько это было возможно, и попробовал воссоздать мир, который он так ужасно хотел - Землю... Но Нереальность была и всегда будет мертвым миром. Шиннок дал Куан Чи место верховного мага за его помощь в борьбе с Люцифером. Если бы Шиннок смог покинуть Нереальность, они могли бы управлять намного большей территорией, но это могло случиться лишь если бы Амулет был у них. Куан Чи тратил столетия, предпринимая тщетные попытки найти Карту Элементов. Храмы Шаолинь хранили священную Карту Элементов в Китае, лишь некоторые избранные знали о ней и ее истории, включая монаха Великого Кунг Лао.

Великий Кунг Лао, Чемпион Смертельной Битвы, пал в сражении с Принцем Горо, а Шанг Сунг поработил его душу. Колдун обнаружил расположение священной Карты Элементов через мысли Кунг Лао. Приблизительно десятью годами ранее, Шан Цунг договорился с Куан Чи: в обмен на расположение карты, Шиннок должен был забрать душу Синдел, наполнить ее злом и повторно возродить на Земле. Это заняло бы 10 лет, что давало Шао Кану возможность пройти через ворота между Землей и Внешним Миром, чтобы возвратить его королеву. Так Кан мог бы завладеть Землей, и оградить себя от вмешательства Рейдена и Старших Богов.

Узнав, где находится священная карта, Куан Чи нанимает воина Лин Куэй - Саб-Зиро - и посылает его в Китай. Саб-Зиро с легкостью находит карту, а потом и Священный Амулет, побеждаю четырех божественных страж. Куан Чи находит то, что искал на протяжении столетий. Однако Рейден рассказывает ледяному воину про последствия и убеждает его вернуть реликвию. Саб-Зиро возвращает Лорду Рейдену похищенный им артефакт, побеждая Куан Чи и Шиннока. Чего не знали ни воин Лин Куэй, ни бог Грома - Амулет был не настоящим. Куан Чи подменил его, оставив у себя настоящий.

Во время своего пребывания в Нижнем Мире, Шиннок сплотил вокруг себя целую армию союзников, готовую отомстить за поражение своего лидера от рук Рейдена. С помощью своих союзников в Земном Царстве и Эдении, которыми стали Нуб-Сайбот и Таня, Шиннок сбежал в недавно освобождённую Эдению и смог вернуться на небеса. Он похитил королеву Синдел и Принцессу Китану во время захвата Эдении. Затем, будучи на Небесах, Лорд Шиннок начинает войну против Старших Богов. Фуджин и Рейден смогли сбежать на Землю, где они собрали Земных Защитников для участия в очередной битве за существование миров. После длинной и тяжёлой битвы, Лью Канг смог победить Шиннока. Тёмный Лорд снова был сослан в Нижний Мир.

Полчища демонов пытались свергнуть Шиннока с трона Преисподней. Дворец Тёмного Лорда был порабощен, когда он встретил того, кого не видел уже много тысяч лет. Это был Тейвин, сын Аргуса - божественного Защитника Эдении.

Когда-то Шиннока считали другом этой семьи, таковым его и запомнил Тейвин. Эденийский воин проспал много веков, не зная, что Шиннок стал воплощением зла. Он помог падшему богу освободить Дворец Лорда Тьмы, после чего продолжил свой путь. Тогда Шиннок и узнаёт о Армагеддоне и Блейзе, в котором томится богоподобная мощь. Шиннок не мог допустить, чтобы Силы Добра завладели этой мощью. Он освобождает Онагу с нижнего уровня Нереальности и вместе с ним и Куан Чи вырывается в Земное Царство. Вскоре они заключают союз с Шао Каном и Шанг Сунгом, образуя альянс Лордов Тьмы. Сошедший с ума после недавнего перерождения - Лорд Рейден - также заключает союз с падшим богом. Шиннок и Куан Чи собирают армию Тьмы для последнего сражения в кратере Эдении. Он должен был завладеть силой Блейза, чтобы навсегда вырваться из Нереальности и отомстить Высшим богам за тысячелетия, что он прошел в глубинах Ада. Армагеддон начался...